巴勒斯坦和阿富汗是邻国，两个国家在地理上非常接近，都是联结西亚、南亚以及重要的十字路口。此外，两个国家周边都是一个较为强大或者强硬的国家或者联盟，东南方向的印度，东北方向的我国，西方的伊朗，北方的俄罗斯以及众多斯坦国家联盟。比起周围的国家来说，阿富汗和巴基斯坦是弱小的，合并似乎是一个实现国家崛起的捷径。
可惜，巴基斯坦不可能同阿富汗合并。两个国家之间的合并本来就非常艰难，对于巴基斯坦和阿富汗来说，就更加不可能实现了。举个例子，巴基斯坦在一九四七年申请加入联合国的时候，只有阿富汗这一个国家投了反对票，两个国家的仇恨可见一斑。
巴基斯坦和阿富汗的仇恨相当狗血，是老套但无往不利的领土纠纷。为了获取更大的殖民利益，英国政府一八九三年逼迫阿富汗，迫使阿富汗划出了所谓的杜兰线，割出了一大部分领土并划入了英属印度。几十年之后，英属印度殖民地独立并划分为两个国家，印度以及占据了部分原阿富汗领土的巴基斯坦。
无论是历史还是现在，阿富汗一直将相关地区视为阿富汗的一部分，都希望可以夺回失去的领土。由于领土纠纷，阿富汗和巴基斯坦冲突不断。阿富汗政府在一九五零年同印度形成反巴战略同盟（双方签订了友好协议），暗中扶持动乱实力，更是在一九六一年和巴基斯坦正式断绝外交关系。阿富汗和巴基斯坦最初的双边关系非常糟糕，双方一度成为敌对国家，两国冲突甚至战火不曾间断。
二十世纪八十年代，苏联在阿富汗成立了亲苏政府，该政府继续维持同印度的同盟关系，也就再次站在了巴基斯坦的对面。为了应对新的苏阿印组合，巴基斯坦果断同美国进行接触，共同援助阿富汗境内的反苏势力，例如后来被剿灭的本拉登。此后，塔利班组织执掌阿富汗，阿富汗和巴基斯坦的关系一度缓和。
塔利班等反苏组织一直受美巴援助，自然不会再次向巴基斯坦讨要领土，两国的关系一度转暖，巴基斯坦和阿富汗出现了短暂的和平。
不幸的是，新政府很快因美国发动的阿富汗战争垮台，刚刚转暖的阿巴关系再次陷入停滞。两个国家的关系刚刚升温，便因为战争再次陷入冰期。
目前，巴基斯坦和阿富汗仍然时有军事摩擦，相关新闻报道不断。
对于仇怨深重的两国来说，合并是一件不可能的事情。
巴基斯坦是一个多民族国家，其信仰虽然同阿富汗一致，但是信仰并不能抹平国仇。
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