后太祖亲理，得病笃重，传佗专视后。佗曰：“此近难济，恒事攻治，可延岁月。”佗久远家思归，因曰：“当得家书，方欲暂还耳。”到家，辞以妻病，数乞期不反。太祖累书呼，犹不上道。太祖大怒，使人往检。若妻信病，赐小豆四十斛，宽假限日;若其虚诈，便收送之。于是传付许狱，考验首服。荀彧请曰：“佗术实工，人命所县，宜含宥之。”太祖曰：“不忧，天下当无此鼠辈耶?”遂考竟佗。(《三国志·魏书·华佗传》)
根据上述《三国志》的记载，曹操晚年因患“头风”之病，便请华佗来为自己诊治，华佗便说，“此病在短期内很难治好，即便是长期坚持治疗，也只能延长一定时间寿命罢了”。曹操便请华佗随侍身边为自己诊治，后华佗因离家太久而想要回家看看，便向曹操请了假。华佗返家之后，曹操多次召其返回，华佗却推说自己妻子有病，多次请求延长假期，就是不返回。
曹操眼看华佗不愿返回，甚至不惜下诏令让郡县征发遣送，谁知华佗仍然不肯上路，曹操一气之下派人前去查看：若是其妻真的病了，便赐予小豆四十斛，准许其延长假期;如果华佗撒谎，只是以妻子生病为托词，那么就将其现场逮捕。
最终果然发现华佗撒谎，于是便将华佗予以逮捕，投入了许昌监狱，经过严刑审讯，华佗表示认罪。荀彧以华佗“医术高超”为由为其求情，但曹操却说，“不用担忧，天下难道还缺少医术高超之人吗?”结果最终导致华佗被严刑拷问致死。
那么，华佗为何要说谎请假，面对曹操的召回又迟迟不肯返回呢?接下来这段推测，可能会颠覆大家对华佗的印象。
《三国志·华佗传》中有在，“佗之绝技，凡此类也。然本作士人，以医见业，意常自悔”，意思是说，华佗虽然医术高超，但他本来却是想要做官的，如今以行医求生，令华佗极为懊悔。在我们现代人看来，像华佗这种医术高超的医生必然是极为受人尊敬的，其实并不然，彼时医生属于“方技”，如华佗的传记便被列入了《三国志·魏书·方技传》，乃是当时的“贱业”，这自然令华佗极为懊恼。
因此，华佗极可能趁着为曹操治病的机会，向其求取官职。要知道，曹操当时可是朝廷的实际掌权人，华佗之所以长期跟随在其身边为其诊治，想必也是想要以此作为自己的入仕之途，从而摆脱为人役使以求食的境况。
然而，华佗最为人称道的便是医术，曹操之所以将华佗留在身边，也只是因为他的医术能够治疗自己的疾病，或者说至少能缓解自己的痛苦，又岂会轻易封其官职，即使答应封其为官，在自己的病完全治愈之前，也不大可能履行。
久而久之，华佗眼看曹操并无提拔自己的意图，便假称收到家书，想要回家看看，就此返回家中。而其之所以返家之后迟迟不肯返回，我猜可能是想要让曹操意识到自己的重要性，从而为自己求取个一官半职，然而让他没想到的是，曹操根本不在乎他的医术，直接便将其押入大牢拷打而死。
《三国志·华佗传》记载，华佗被拷打致死后，曹操曾说，“华佗虽然能治愈我的疾病，但却有意养着我的病(一直不给除根)，借以提高自己的地位，即使我不杀他，他也不会为我彻底根治”。
太祖曰“佗能愈此。小人养吾病，欲以自重，然吾不杀此子，亦终当不为我断此根原耳”(《三国志·魏书·华佗传》)
由此可见，华佗之所以被杀，主要便是源于他想要以曹操的病为要挟，想要为自己求取一官半职，但却没想到最终丧命于此。这些虽然大多为猜测，但从最后曹操的话来看，并非没有道理。
